За год Верховный суд РФ рассмотрел несколько дел о нецелевом расходовании средств ОМС на оплату расходов медорганизаций и оплату медицинской помощи. Во всех спорах решения были приняты не в пользу клиник.
Множество вопросов возникает относительно законности выплаты заработной платы узкоспециализированных сотрудников: патологоанатомов, дерматовенерологов, наркологов и психотерапевтов, генетиков, фтизиатров, эпидемиологов, психологов, спортивных врачей, работников аптек и немедицинских работников. По общему правилу средства ОМС не покрывают расходы на их зарплату по тем заболеваниям, финансирование которых осуществляется за счет региональных бюджетов. Для патологоанатомов, например, также решающее значение имеет статус пациента (живой или умерший), для которого проводились исследования, потому что умершие фактически теряют статус застрахованного в системе ОМС.
Важную роль играют также соответствие сотрудников регуляторным требованиям и наличие лицензии. Оплата труда работников, если у них отсутствуют сертификаты аккредитации или у больницы нет лицензии, считается нецелевыми расходами.